防治蔬菜病害，杀菌剂不可或缺，针对蔬菜根部病害，杀菌剂灌根是一种最有效的方式。杀菌剂灌根操作虽然最简单，但是也需要按照一定的规则，否则杀菌效果就会大打折扣。
要选择针对性强，并且防效较好的杀菌剂，不要盲目用药，以免延误防治时机，同时要尽可能地减少浪费。
杀菌剂尽量与氨基酸类液肥或具有刺激根系发育的激素混合施用，药液的浓度以不高于1500倍为宜，防止蔬菜根系周围土壤药液浓度过高，造成药害。
一是土壤生物要兼顾。选择的杀菌剂施入土壤后不能破坏土壤内部的生物群体和生态平衡。如已施用菌肥的棚室，最好还是不要用杀菌剂灌根防病，以防杀死菌肥中的有益微生物，使菌肥失去肥效。当然，如果蔬菜已发生病害，而又必须用杀菌剂灌根，则不必考虑菌肥中有益微生物是否会受损，以免因小失大，导致病害暴发。
二是灌根前不宜浇水。这是因为蔬菜的根部病害已发生，浇水后病菌会随流水进行传播，造成更多死棵。同时浇水还轻易造成土壤透气性下降，使蔬菜根部缺氧，产生沤根，植株抗逆性降低，病原菌更容易浸染，加剧死棵的发生。
三是灌根后不宜立即浇水。灌根后立即浇水，会使土壤中的药液很快稀释，杀菌防病效果降低。若缺水，可在定植沟内浇一小水，以水面到垄高的1/3为宜，绝对不能漫过垄面。
四是药害补救要及时。杀菌剂灌根后，作物如果出现萎蔫、黄化、停止生长等药害症状，应及时进行补救，防止造成较大损失。可以迅速浇一次清水，以稀释土壤中的药液浓度，并及时用爱多收或云大120喷淋加灌根，以缓解药害，促使根系尽快恢复生机，让植株转入正常生长。
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